

Genomika proiektua
Ambar bateko moskito baten genomaren analisia


Kodetzen duen proteinaren sekuentzia
MEHTRLLSAVVLLGLLLLGSAPPSQGARILGILPSVGRSHYIIGAGLMKALLDAGHEVTI
VSPYPMKDAPAGLHRDILLPDLATSHGVSGPDLFQYKSAPNLMVLYLVYSEIGPQASEAL
LQHPKMVELMQSGERFDAVIVESFASEVLYGLAEHFGGQLFVFSPFGASMWTNELVGTPY
PYSYIPHTFLSYTNEMSFWQRFTNALVGHADKLYYRCVFLPQQEAMYRRFFPNAKLTFQQ
TLESVRLAFVNQHFTLSYPHPYAPNMVEIGGIQIQPAKKLPADIQKYIDEAPHGVIYFSM
GSMLKGRNFPEDKRAAFVNVFRGLKENVIWKYENDSLPDKPPNVLIKAWMPQSDILAHPK
VKLFITHGGLLGTTEGLYHGKPMVGIPIYGDQELNLARAEQAGYGVKLDYDTLSEETIAA
AIRTVLDGPAYGERARLISDRYRDQPLGPAKAAVYWVEYVLRHKGAPQLQSPSVRLSFVQ
YNLLDVYAVMGAIALSVLIGAGLMLRALLTSRANLRKKKAKPNSPIRQCAKDVGEEVGW
Sekuentziaren luzera: 539 aminoazido
Kyte & Doolittle hidrofobizitate eskala erabilita, 20 aminoazidoen banako balioak hurrengoak dira:
Informazio proteikoa
Esperotako erdibizitza:
Amino mutur terminalean metionina dago azken base.
Proteina honek 30 orduko ezdi-bizitza adierazi du in vitro erretikulozitoetan egindako saiakuntzetan. Bestalde, in vivo legamietan, 20 orduko erdi-bizitza agertu izan du, eta azkenik, in vivo Escherichia coli-n egindako ikerketetan, 10 ordu.
Ez-egonkortasun indizeari dagokionez, hurrengo balioa dauka: 34.59. Hori dela eta, proteina egonkortzat hartuta dago.
Aminoazido konposizioa
Amino acid composition
Ala (A) 49 9.1%
Arg (R) 25 4.6%
Asn (N) 16 3.0%
Asp (D) 21 3.9%
Cys (C) 2 0.4%
Gln (Q) 23 4.3%
Glu (E) 27 5.0%
Gly (G) 43 8.0%
His (H) 16 3.0%
Ile (I) 27 5.0%
Leu (L) 65 12.1%
Lys (K) 26 4.8%
Met (M) 16 3.0%
Phe (F) 22 4.1%
Pro (P) 38 7.1%
Ser (S) 33 6.1%
Thr (T) 18 3.3%
Trp (W) 6 1.1%
Tyr (Y) 28 5.2%
Val (V) 38 7.1%
Pyl (O) 0 0.0%
Sec (U) 0 0.0%
Atzera
Proteinaren funtzioa
UDP-glukuronosil/UDP-glukosiltransferasa familiako proteina da gene honen produktua. Honen funtzioa UTP-azukre batetik molekula hidrofobiko txiki batera glikosilo taldearen transferentzia katalizatzea da. Entzima honek bere funtzioa dauka bai bidezidor anaboliko bai katabolikoetan substantzia kimikoak transformatzen. Nagusiki, entzima hauek molekula txikietan aldaketak gauzatzen dituzte, baina euren funtzio posibleen artean topatu izan da baita ere DNA-ren konponketa eta proteinen intesi eta degradazioa. Bai bide anaboliko, bai bide katabolikoetan parte hartzea, eta aipatutako funtzio garrantzitsu hauek izateak, proteina hau garrantzitsua dela pentsatzera garama, ikusi beharko dugu lortutako datuekin hipotesi hori baiezta dezakegun edo deuseztatzen dugun.
Bestalde, aipatzekoa da, familia honetako entzimek, Uniprot datu basearen arabera, 50 nukleotidoko sekuentzia kontserbatua daukate karboxilo muturrean. Dena den, gure contig-eko proteina sekuentzia lortu dugunez eta ortologoekin konparatu dugunez gero, behatu ahal izango dugu kontserbazio hori mantentzen den edo ez, 50 nukleotidoko sekuentzia horrek pentsatzen dugun garrantzia duen edo ez baieztatu ahal izateko.